当然，此时的元稹并没有将自己的职责忘在脑后，他一边与薛涛在诗文唱和，缠绵缱绻;一边高举反腐倡廉大旗，在两川掀起了震动京师的廉政风暴。他抓住剑南东川节度使的腐败问题一查到底，竟然一口气掀翻了七个府县官员。此案一时震动朝野，元稹也因此出尽风头。此后不久，元稹再接再厉地又在山西查处了一桩腐败大案，致使山西一批府县官员纷纷落马。
元稹在东川查处了地方高级官员们贪赃枉法、迫害百姓的廉政风暴，受到了两川的黎民百姓的欢迎和拥戴。白居易在《河南元公墓志铭》中写到：“(元稹)名动三川，三川人慕之，其后多以公姓字名其子。”这就是说，老百姓为了感激元稹为民做主，连给自己的子女们取名都用元稹姓或名。但是，他大张旗鼓的反腐倡廉却得罪了大太监仇士良，第二年就把他再次赶到地方上当了个小官吏。
元稹在奉命调回长安的路上投宿馆驿，半夜，碰巧仇士良也大驾光临。仇士良得知驿馆的上房被元稹占了，就让他识相点把房间让出来。说让就让也太没面子了，元稹自然没肯答应。仇士良身边的大小太监对着元稹就是一顿猛抽猛打，打得元稹“袜而走厅后。士元追之，后以棰击稹伤面。”事情闹到长安，仇士良是权倾朝野的人物，当然不会有错，那元稹就一定不对了。这个时候，元稹的反腐倡廉得罪的人纷纷落井下石。调查结论是元稹举动有失官员体面，时任宰相的李吉甫便乘机建议唐宪宗把元稹被贬为江陵府士曹参军。为此，白居易等人多次为元稹鸣不平，但改变不了事情的结局。
元稹调离了两川，也就离开了薛涛。两年后，元稹就娶了小妾安仙嫔。四年之后，他续娶了裴氏为妻。当时，元稹与薛涛分别时，不敢当面辞行，只写了一首诗给她，诗曰：
“锦江滑腻峨嵋秀，生出文君与薛涛;言语巧似鹦鹉舌，文章分得凤凰毛。纷纷辞客多停笔，个个公侯欲梦刀;别后相思隔烟水，葛蒲花发五云高。”
言下之意：我要走了，走得远远的，但是我会想你的。
唐穆宗长庆元年，即公元821年，经过一番奋发努力，元稹被提升为中书舍人，充翰林院承旨。第二年，便进居相位。但他仅仅干了三个月的宰相，便被贬为浙东按察使。一时寂寞，便想起了薛涛。本来想把薛涛接到他那里去住。这时候距他与薛涛蜀中一别，倏忽已有十二年矣!回想当年恍如隔世的缠绵之情，已经42岁的元稹，是否还能对年逾花甲的薛涛一往情深?但就在此时，一位新人进入了元稹的视野，使他再一次把薛涛抛在脑后。
这位新人叫刘采春，是一位美艳少妇，和她的老公一起来元稹府上献艺。刘采春擅长演参军戏，又会唱歌，那种少妇的成熟妩媚让元稹神魂颠倒，他写诗赞她“言词雅措风流足，举止低徊秀媚多”。他包养了刘采春达七年之久。看来他的“曾经沧海难为水，除却巫山不是云。”只不过是一时梦幻时的感受罢了。
薛涛绝望之余，郁郁寡欢，终身未嫁。薛涛暮年退居成都西郊浣浣花溪后，晚年又移居东门锦江南岸建吟诗楼栖息其上，也就是今天的成都望江公园内。薛涛常以律、绝两体写诗，当时流传的笺纸篇幅过大，涛喜爱红色，遂创制深红小笺，时号“薛涛笺”。望江公园内现存古井，名“薛涛井”传当年薛涛便是从井中汲水制笺。
唐文宗太和三年，即公元829年9月，元稹被召回京城出任尚书右丞相，第二年再度出京，任武昌军节度使，在来年的7月暴卒于任所。时年52岁。三年后，63岁的薛涛郁郁寡欢而终。薛涛病逝，葬于现在的望江公园附近。当时镇守成都的西川节度使段文昌为她撰写了墓铭志。如今薛涛墓与碑文早已不存，但在晚唐诗人郑谷《蜀中三首》中，可以窥见当年薛涛墓地的景色：“渚远江清碧箪纹，小桃花绕薛涛坟。”
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