斑马军团的大手笔投入终于获得了回报。包括武齐尼奇、比达尔、利希施泰纳、皮尔洛等一批新援都成为主帅孔蒂的主力人选。
本世纪初，尤文在意甲占据统治地位，自从2000-2001赛季开始直至2005-2006赛季，斑马军团仅仅两次让联赛冠军旁落。
然而，2006年5月“电话门丑闻”东窗事发，尤文总经理莫吉操纵比赛结果，导致斑马军团2004-2005及2005-2006赛季的两座意甲冠军被剥夺，并遭到降级及扣除9分的重罚。主教练卡佩罗跳槽皇马(微博数据)，而卡纳瓦罗、图拉姆、赞布罗塔、维埃拉以及伊布等关键球员纷纷离队，让尤文遭遇前所未有的危机。
好在斑马军团并没有就此沉沦，在布冯、皮耶罗、内德维德及特雷泽盖等忠臣的努力下，在主帅德尚的指挥下，尤文在2006-2007赛季的乙级联赛中提前两轮锁定意乙冠军，重回意甲。
重回意甲的首个赛季，尤文请来拉涅利执教，成绩紧追国米及罗马，位居意甲积分榜第3，重返意甲首年便锁定欧冠资格赛席位，队内两大前锋皮耶罗及特雷泽盖更是包揽射手榜前两位。而接下来的2008-2009赛季，尤文再进一步，费拉拉在联赛还剩2轮时上任。力压米兰夺得联赛亚军。
然而，重夺意甲王座的路并非那般一帆风顺，费拉拉及米兰旧帅扎切罗尼的先后执教，并没有止住尤文下滑的趋势，斑马军团在2009-2010赛季仅仅取得联赛第7，只拿到欧联杯资格赛的名额；
而2010-2011赛季，前切沃教头德尔内里同样没能让尤文实现复苏，斑马军团再度名列意甲第7，同时在欧联杯小组赛阶段便悲惨出局。
不过，尤文并没有让球迷等待太久。2011年5月22日，前队长孔蒂接手尤文教鞭，斑马军团在本赛季意甲前37轮取得22胜15平的不败战绩，最终重夺联赛冠军。
从2011年夏天，以任命孔蒂为主教练和引进皮尔洛为标志，尤文开启了电话门事情后的复兴之路。2011-2012赛季不败夺冠，2013-2014赛季收获102分。孔蒂在一波三连冠后功成身退，在米兰经历了短暂失意后的阿莱格里接过教鞭。
阿莱格里上任后因材施教，对孔蒂留下的技战术打法兼容并蓄，形成了自己的一套执教思路，又将尤文的冠军延续了5年。在这5年间，只有2015-2016赛季，萨里带领的那不勒斯曾一度给尤文施加了压力。而在欧战赛场上，阿莱格里两度带领尤文闯进欧冠决赛，但都屈居亚军。
阿莱格里，“阿囧”教练，一个球员生涯平平无奇的教练，看待技战术的角度更加全面和实际，因为自己球员能力的平庸，因而更加敏感于技战术、人员使用的技巧和时机，而不迷信于巨星。球员经历乏善可陈，早先的执教经历也是以小球队为主，习惯了看菜下碟，他的执教风格平实却灵活，对各种风格的球队和球员都有极强的兼容性，非常善于利用不断的调整和小变化，实现球队效能的最大化。
