那时候团藏提出要建立根，以此来为火影培训兵卫队。
其实当初团藏的目标是为了当火影，可是谁也没有想到最后是猿飞日斩上位，他因为这件事对于团藏一直心怀愧疚，再加上他俩的关系还不错，就不太好意思去拒绝团藏，所以根就顺利的组建了。
在根建立初期，团藏没有搞出什么大的乱子，反而对猿飞日斩坐稳三代火影大有裨益。
第一是从根培养出来进入暗部的人，全部经历过团藏的悉心培育，他用得十分得心应手。
且作为三代火影，有很多的事情他实在不方便去做，所以就由团藏“代劳”。
后来，随着根的不断扩大，团藏的势力也是越来越大。三代火影感觉到了一丝不好的苗头，有心去阻止，可终究是下不了手。
首先团藏在建立根之后，确实是为了他还有村子做出了很大的贡献！
在根和团藏发展壮大之后就打压，实在是让人有“过河拆桥”的感觉。
当然最重要的是猿飞日斩跟团藏之间的那种感情羁绊，就像是宇智波斑之于千手柱间、大蛇丸之于自来也一般，团藏对于猿飞日斩来说同样即使一生的宿敌，同样也是挚友！
出于这份感情，三代火影实在是不想赶尽杀绝。
直到在宇智波一族灭族之后，三代火影才解除了团藏的职务，但是也并没有重罚之所以这样做，有两个原因。
一是当时宇智波一族的叛心已生，当时他也想不出合适的方法去处置宇智波一族，如果任由其发展下去，会威胁到整个村子的安危。
二是在那个时候，团藏的羽翼已经丰满，虽然跟三代火影相比还是有一定的差距，可要真正的去清除团藏势力，能赢，可无疑是杀敌一千、自伤八百。
这样下来，木叶在刚刚损失了宇智波一族、团藏的根的同时，三代火影的势力也被削弱了，直接造成了木叶村内部的空虚。
这个时候如果有外村趁虚而入的话，村子估计更是雪上加霜。
所以在综合考虑之下，三代火影在宇智波一族灭族之后，只是在明面上解除了团藏的职位、解除了根，对根偷偷保留的事就睁一只眼闭一只眼。
且既然已经宣布解除根了，三代火影自然没有义务继续给团藏拨款，他想用这个方法慢慢削减团藏根部的势力。
可是三代火影完全没有预料到团藏竟然勾结了小春、门炎两位顾问，通过私吞已故忍者的残忍方法来维持根的发展！
这种方法，实在太过于伤天害理！
